Browsing by Subject "Thunbergia grandiflora"

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    Genetic mechanisms of invasion: a comparative transcriptomic study between two species of the genus Thunbergia (Acanthaceae)
    (Pontificia Universidad Javariana Cali, 2024) Ruiz Londoño, David; Suárez Barón, Harold Geovanny; Pérez Mesa, Pablo
    Las especies invasoras representan una amenaza significativa para los ecosistemas en todo el mundo, con impactos que se extienden a la pérdida de biodiversidad, la degradación de los ecosistemas y las pérdidas económicas. Comprender los mecanismos genéticos subyacentes a la invasividad es crucial para desarrollar estrategias efectivas de manejo. Por lo tanto, en este estudio, nuestro objetivo fue caracterizar los invasividad observados en Thunbergia alata Bojer ex Sims. Realizamos un estudio transcriptómico comparativo entre T. alata y su congénere Thunbergia grandiflora, dos especies estrechamente relacionadas con comportamientos invasivos contrastantes. El análisis de RNA seq reveló miles de genes diferencialmente expresados (DEGs) entre estas especies y entre diferentes tejidos y etapas de desarrollo dentro de T. alata. La anotación funcional y la clasificación Gene Ontology (GO) de los DEGs proporcionaron información sobre la base genética de sus diferencias ecológicas y morfológicas. Además, una búsqueda dirigida de genes relacionados con la adaptación y la invasividad identificó varios genes candidatos potencialmente implicados en los rasgos invasivos de T. alata. Nuestros hallazgos contribuyen a una mejor comprensión de los mecanismos genéticos que impulsan la invasividad de las plantas y proporcionan información valiosa para el desarrollo de estrategias de manejo específicas.
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    Molecular evolutionary analysis of genes potentially associated with invasiveness in two species of the genus Thunbergia (Acanthaceae)
    (Pontificia Universidad Javeriana Cali, 2025) Ruiz Calero, Santiago; Suárez Barón, Harold Geovanny
    Invasive species present a critical threat to global biodiversity and ecosystems, with significant economic impacts and human health risks. In Colombia, Thunbergia alata and Thunbergia grandiflora (Acanthaceae) are introduced species that exhibit contrasting patterns of invasiveness. T. alata has rapidly expanded in Andean forests and highly disturbed areas, whereas T. grandiflora shows no evident invasive behavior in the country. This study aimed to analyze molecular evolutionary patterns of genes potentially associated with invasiveness by identifying selection signals in genes involved in the adaptation of both species to new environment. We selected 32 candidate genes through differential expression analysis, gene ontology annotations, and literature review, focusing on processes such as development, reproduction, metabolism, and stress response. We conducted a gene co-expression analysis which revealed functionally enriched modules exclusively in T. alata. In parallel, we carried out a positive selection analysis based on codon substitution models identifying specific amino acid sites under selective pressure in five genes (POK, ANJ1, ACLB1, NAC92, and DEGP1), associated with vesicle trafficking, protein folding, metabolism, and stress tolerance. These findings suggest that positive selection on specific sites may be linked to mechanisms of gene neofunctionalization or subfunctionalization, enhancing adaptive capacity and invasive potential. The comparative analysis between both species contribute to a better understanding of the genetic mechanisms underlying plant invasiveness. However, further functional validation of these genes and also an exploration of alternative molecular pathways are essential to fully elucidate the genetic basis driving adaptive and invasive traits in invasive species.