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Browsing by Subject "Transcriptoma"

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    Genetic mechanisms of invasion: a comparative transcriptomic study between two species of the genus Thunbergia (Acanthaceae)
    (Pontificia Universidad Javariana Cali, 2024) Ruiz Londoño, David; Suárez Barón, Harold Geovanny; Pérez Mesa, Pablo
    Las especies invasoras representan una amenaza significativa para los ecosistemas en todo el mundo, con impactos que se extienden a la pérdida de biodiversidad, la degradación de los ecosistemas y las pérdidas económicas. Comprender los mecanismos genéticos subyacentes a la invasividad es crucial para desarrollar estrategias efectivas de manejo. Por lo tanto, en este estudio, nuestro objetivo fue caracterizar los invasividad observados en Thunbergia alata Bojer ex Sims. Realizamos un estudio transcriptómico comparativo entre T. alata y su congénere Thunbergia grandiflora, dos especies estrechamente relacionadas con comportamientos invasivos contrastantes. El análisis de RNA seq reveló miles de genes diferencialmente expresados (DEGs) entre estas especies y entre diferentes tejidos y etapas de desarrollo dentro de T. alata. La anotación funcional y la clasificación Gene Ontology (GO) de los DEGs proporcionaron información sobre la base genética de sus diferencias ecológicas y morfológicas. Además, una búsqueda dirigida de genes relacionados con la adaptación y la invasividad identificó varios genes candidatos potencialmente implicados en los rasgos invasivos de T. alata. Nuestros hallazgos contribuyen a una mejor comprensión de los mecanismos genéticos que impulsan la invasividad de las plantas y proporcionan información valiosa para el desarrollo de estrategias de manejo específicas.
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