Aislamiento e identificación de bacterias solubilizadoras de fosfatos (BSF) asociadas a la rizósfera de vanilla spp.
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Date
2019
Authors
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Publisher
Pontificia Universidad Javeriana Cali
Abstract
Los suelos de la región biogeográfica del Choco en la costa pacífica colombiana son altamente ácidos, lo que conduce a una baja disponibilidad de nutrientes para las plantas, en particular el fósforo. Una estrategia adoptada por las plantas a los suelos ácidos es la asociación con microorganismos de la rizósfera, tanto hongos como bacterias, que contribuyen a mejorar la disponibilidad de los nutrientes. La estrategia adoptada por las bacterias rizosféricas solubilizadoras de fosfato contribuyen a mejorar la eficiencia de utilización del mismo. En la presente investigación se evaluó el aislamiento e identificación de bacterias solubilizadoras de fosfato asociadas a la rizósfera de plantas silvestres de Vanilla spp. Para lo cual, se planteó como objetivos: 1) Identificar el mejor medio de cultivo selectivo y la mejor dilución para el aislamiento de Bacterias Solubilizadoras de Fosfato (BSF); 2) Estandarizar la metodología para la preservación y reactivación de BSF; 3) Identificar a nivel molecular, las especies bacterianas presentes en la rizósfera de algunas especies silvestre de Vanilla. De seis especies de Vanilla colectadas en dos municipios del Valle del Cauca fue posible obtener un total de 612 aislamientos, de los cuales 100 fueron seleccionados por morfotipo y de estos 65 fueron identificados hasta especie.. Para considerar el mejor medio de cultivo selectivo y dilución se realizó la prueba de Regresión de Poisson, la cual indicó el medio Pikovskaya (PVK) y la dilución 10-4 como las mejores condiciones para el aislamiento de BSF. La estandarización de la metodología de preservación y reactivación de las BSF mediante el análisis de prueba de Fisher permitió identificar que se pierde el 25% de la población total preservada seis (6) meses después de su preservación. De igual forma, la identificación de los aislamientos se realizó mediante la secuenciación de la región ribosomal 16S y búsquedas BLAST en GenBank predominando géneros como Burkholderia y Bacillus.
Description
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The soils of the biogeographic region of Choco on the Pacific coast of Colombia are highly acidic, which leads to low nutrient availability for plants, particularly phosphorus. A strategy adopted by plants in acidic soils is the association with rhizosphere microorganisms, both fungi and bacteria, which help improve nutrient availability. The strategy adopted by phosphate-solubilizing rhizosphere bacteria contributes to enhancing the efficiency of phosphorus utilization. In this research, the isolation and identification of phosphate-solubilizing bacteria associated with the rhizosphere of wild plants of Vanilla spp. were evaluated. The objectives were: 1) To identify the best selective culture medium and dilution for the isolation of Phosphate Solubilizing Bacteria (PSB); 2) To standardize the methodology for the preservation and reactivation of PSB; 3) To identify at the molecular level the bacterial species present in the rhizosphere of some wild species of Vanilla. From six species of Vanilla collected in two municipalities of Valle del Cauca, a total of 612 isolates were obtained, of which 100 were selected by morphotype, and of these, 65 were identified to the species level. To determine the best selective culture medium and dilution, a Poisson Regression test was performed, which indicated that the Pikovskaya (PVK) medium and the 10-4 dilution were the best conditions for the isolation of PSB. The standardization of the preservation and reactivation methodology of PSB through Fisher's test analysis allowed the identification of a 25% loss of the total preserved population six (6) months after preservation. Similarly, the identification of the isolates was carried out through 16S ribosomal region sequencing and BLAST searches in GenBank, with genera such as Burkholderia and Bacillus predominating.
Keywords
Bacterias solubilizadoras de fosfato, Rizósfera, Cultivo selectivo, Phosphate-solubilizing bacteria, Rhizosphere, Selective culture