Respuesta funcional a la sequia de genes ortólogos provenientes de caña de azúcar (saccharum spp.) en el organismo modelo Arabidopsis thaliana
Date
2018
Authors
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Publisher
Pontificia Universidad Javeriana de Cali
Abstract
La pérdida inducida por la sequía en el rendimiento de los cultivos es uno de los problemas más graves que tenemos en la actualidad. A pesar de que las plantas tienen una serie de respuestas la mayoría de las veces no son suficientes para sobrevivir al estrés o se ve afectada de manera significativa su producción. La caña de azúcar es uno de los monocultivos cultivados en Colombia, principalmente en el Valle del Cauca, por sus beneficios económicos derivados de la producción de azúcar, bioetanol, papel reciclable y energía. Como producto de un trabajo de bioinformática y tecnologías de secuenciación de próxima generación, se identificaron genes potenciales involucrados en tolerancia al estrés hídrico en caña de azúcar (Riascos-Arcos et al., 2015), para finalmente tener una lista de genes potenciales con patrones de expresión diferenciales (Riascos, comunicación personal). El objetivo de este trabajo es establecer la respuesta funcional a la sequía de cinco genes provenientes de caña de azúcar a partir del análisis de genes ortólogos en la planta modelo A. thaliana (AT5G13330 (RAP2.6L), AT3G14230 (RAP2.2), AT1G53910 (RAP2.12), AT1G19715 y AT1G73040). Para esto, se realizó una revisión funcional en bases de datos y fuentes bibliográficas, se seleccionaron mutantes de la colección Salk los cuales fueron genotipados, y evaluados en experimentos funcionales al estrés por sequía lo que permitió hacer comparaciones entre los fenotipos de las plantas mutantes y control, para establecer si los genes ortólogos se relacionan con una tolerancia a la sequía. Este trabajo es un primer reporte de la posible funcionalidad que cumple en la planta AT1G19715 y AT1G73040 en estrés por sequía y relaciona este par de genes de manera bioinformática en procesos como la fotosíntesis y respuesta a la luz. También, se comprobó que RAP2.2 tiene una respuesta a la sequía. Estos resultados son importantes y marca un camino para evaluar estos genes potenciales en caña de azúcar con el objetivo de obtener variedades de caña que requieran menor cantidad de riegos y no disminuyan (significativamente) su producción.