Genetic mechanisms of invasion: a comparative transcriptomic study between  two species of the genus Thunbergia (Acanthaceae)

Ruíz Londoño, David

Genetic mechanisms of invasion: a comparative transcriptomic study between two species of the genus Thunbergia (Acanthaceae)

dc.contributor.advisor	Suárez Barón, Harold Geovanny
dc.contributor.advisor	Pérez Mesa, Pablo
dc.contributor.author	Ruíz Londoño, David
dc.date.accessioned	2025-02-13T21:45:40Z
dc.date.available	2025-02-13T21:45:40Z
dc.date.issued	2024
dc.description.abstract	Las especies invasoras representan una amenaza significativa para los ecosistemas en todo el mundo, con impactos que se extienden a la pérdida de biodiversidad, la degradación de los ecosistemas y las pérdidas económicas. Comprender los mecanismos genéticos subyacentes a la invasividad es crucial para desarrollar estrategias efectivas de manejo. Por lo tanto, en este estudio, nuestro objetivo fue caracterizar los invasividad observados en Thunbergia alata Bojer ex Sims. Realizamos un estudio transcriptómico comparativo entre T. alata y su congénere Thunbergia grandiflora, dos especies estrechamente relacionadas con comportamientos invasivos contrastantes. El análisis de RNA seq reveló miles de genes diferencialmente expresados (DEGs) entre estas especies y entre diferentes tejidos y etapas de desarrollo dentro de T. alata. La anotación funcional y la clasificación Gene Ontology (GO) de los DEGs proporcionaron información sobre la base genética de sus diferencias ecológicas y morfológicas. Además, una búsqueda dirigida de genes relacionados con la adaptación y la invasividad identificó varios genes candidatos potencialmente implicados en los rasgos invasivos de T. alata. Nuestros hallazgos contribuyen a una mejor comprensión de los mecanismos genéticos que impulsan la invasividad de las plantas y proporcionan información valiosa para el desarrollo de estrategias de manejo específicas.
dc.description.abstracteng	Invasive species pose a significant threat to ecosystems worldwide, with impacts extending to biodiversity loss, ecosystem degradation, and economic losses. Understanding the genetic mechanisms underlying invasiveness is crucial to developing effective management strategies. Therefore, in this study, we aimed to characterize the invasiveness observed in Thunbergia alata Bojer ex Sims. We performed a comparative transcriptomic study between T. alata and its congener Thunbergia grandiflora, two closely related species with contrasting invasive behaviors. RNA seq analysis revealed thousands of differentially expressed genes (DEGs) between these species and between different tissues and developmental stages within T. alata. Functional annotation and Gene Ontology (GO) classification of the DEGs provided insights into the genetic basis of their ecological and morphological differences. Furthermore, a targeted search for genes related to adaptation and invasiveness identified several candidate genes potentially involved in invasive traits of T. alata. Our findings contribute to a better understanding of the genetic mechanisms driving plant invasiveness and provide valuable information for the development of targeted management strategies.
dc.format.extent	57 p.
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11522/4450
dc.language.iso	eng
dc.publisher	Pontificia Universidad Javariana Cali
dc.publisher.faculty	Facultad de Ingeniería y Ciencias
dc.rights.accessrights	http://purl.org/coar/access_right/c_16ec
dc.rights.creativecommons	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject	Thunbergia alata
dc.subject	Thunbergia grandiflora
dc.subject	Especies invasoras
dc.subject	Transcriptoma
dc.subject	Adaptación
dc.thesis.discipline	Facultad de Ingeniería y Ciencias. Biología
dc.thesis.grantor	Pontificia Universidad Javeriana Cali
dc.thesis.level	Pregrado
dc.thesis.name	Biólogo(a)
dc.title	Genetic mechanisms of invasion: a comparative transcriptomic study between two species of the genus Thunbergia (Acanthaceae)	eng
dc.type.coar	http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.local	Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dc.type.redcol	https://purl.org/redcol/resource_type/TP