Caracterización de potenciales hongos micorrízicos aislados de plantas adultas y semillas  cebo de la orquídea amenazada, Cattleya quadricolor Lindl (Orchidaceae)

Ramírez Bejarano, Erika Vanessa

Caracterización de potenciales hongos micorrízicos aislados de plantas adultas y semillas cebo de la orquídea amenazada, Cattleya quadricolor Lindl (Orchidaceae)

dc.contributor.advisor	Mosquera Espinosa, Ana Teresa
dc.contributor.advisor	Ventre Lespiaucq, Agustina
dc.contributor.advisor	Flanagan, Nicola Sian
dc.contributor.author	Ramírez Bejarano, Erika Vanessa
dc.date.accessioned	2024-07-04T15:08:08Z
dc.date.available	2024-07-04T15:08:08Z
dc.date.issued	2022
dc.description.abstract	Las orquídeas establecen una simbiosis obligatoria con Hongos Micorrízicos Orquidioides (HMO), fundamentales para la germinación de las semillas y el apoyo a la nutrición en plantas adultas. La especificidad de la relación que se establece entre orquídea-HMO varía según las especies e incluso entre las diferentes etapas de vida de la planta. El presente estudio, tuvo como objetivos aislar, caracterizar morfológica y molecularmente para comparar la diversidad de potenciales hongos micorrízicos de plantas adultas y semillas cebo de Cattleya quadricolor, una orquídea epífita y endémica del Valle geográfico del río Cauca en Colombia. Esta especie estaamenazada (EN) producto de la degradación de su hábitat natural, el Bosque Seco Tropical (BST) y de la extracción ilegal para el comercio de plantas. Se hicieron muestreos aleatorios y se tomaron tres porciones de raíces en nueve plantas de C. quadricolor. Además, se colocaron paquetes con semillas cebo para la captura de HMO durante dos períodos: 63 y 181 días, después de su instalación. Se aislaron en cultivo puro posibles hongos micorrízicos y se identificaron mediante el código de barras de la vida de la región rRNA-ITS. Las secuencias fueron editadas y alineadas en Geneious 6.0.6 y se compararon con secuencias de GenBank. Se aislaron e identificaron 26 cepas fúngicas, de las cuales, se determinaron tres aislamientos de potenciales HMO aislados a partir raíces de plantas adultas; dos de los aislamientos corresponden al género Tulasnella y uno al género Ceratobasidium. De la metodología de semillas cebo no se obtuvieron aislamientos de potenciales HMO. Dos análisis filogenéticos fueron realizados en MEGA 11.0.11 para el género Tulasnella y Ceratobasidium. Se encontró que los dos aislados de Tulasnella pertenecen a clados distantes, donde uno, tiende a establecer relaciones limitadas a ciertos taxones de orquídeas, a comparación del otro. El aislado de Ceratobasidium, por su lado, es cercano a hongos reportados como endófitos, micorrízicos y fitopatógenos de diferentes orquídeas y taxones de plantas en el planeta, incluyendo a Buenaventura en el departamento del Valle del Cauca, Colombia. Además, se obtuvo hongos reportados como endófitos, donde resaltan posibles Hongos Endófitos Septados Oscuros (HESO), pertenecientes a los géneros Aaosphaeria y Colletotrichum. Los hongos aislados en cultivo puro se conservaron ex situ para futuras pruebas de germinación simbiótica in vitro. Este es el primer estudio sobre la diversidad de hongos con potencial benéfico aislados de C. quadricolor, que determina taxones de potenciales HMO para apoyar la germinación de semillas y proporciona conocimiento sobre las 9 posibles asociaciones micorrízicas de C. quadricolor en su etapa adulta. Este estudio representa un importante recurso biológico para la restauración de las poblaciones de esta orquídea endémica y en grave peligro de extinción.
dc.description.abstracteng	Orchids have an obligatory symbiosis with orchid mycorrhizal fungi (OMF) for seed germination in the wild, and nutrition in adult plants. The specificity of the relationship established between plant-OMF varies according to orchid species, and even between the different life stages of the plant. The present study aimed to isolate, molecularly identify and compare the diversity of potential mycorrhizal fungi from roots of adult plants and bait seeds of Cattleya quadricolor, an epiphytic orchid endemic to the geographic valley of the Cauca River in Colombia. This species is categorized as 'Endangered' at the national level, a consequence of extensive degradation of its native Tropical Dry Forest (TDF) habitat, and illegal extraction of plants for trade. Three root portions were randomly sampled from nine C. quadricolor plants. In addition, bait seed packets were place to capture of HMO over two periods: 63 and 181 days. Potential mycorrhizal fungi were isolated in pure culture and identified using rRNA-ITS sequence data for DNA barcoding. The sequences were edited and aligned in Geneious 6.0.6 and compared with GenBank sequences. Twenty-six fungal strains were isolated and identified, of which three isolates of potential HMO isolated from roots of adult plants were determined; two of the isolates correspond to the genus Tulasnella and one to the genus Ceratobasidium. In the bait seed methodology, no potential HMO isolates were isolated. Two phylogenetic analyses were performed in MEGA 11.0.11, for the genus Tulasnella and for Ceratobasidium. The two Tulasnella isolates belonged to distant clades, where one tends to establish relationships limited to certain orchid taxa, as compared to the other. The Ceratobasidium isolate is related to fungi with endophytic and/or pathogenic function, isolated from different geographical locations, including Buenaventura in the department of Valle del Cauca Colombia. In addition, we report possible Dark Septate Endophytic fungi (DSE), belonging to the genus Aaosphaeria and Colletotrichum. Fungi isolated in pure culture were conserved ex situ for future in vitrosymbiotic germination tests. This is the first study on the diversity of potential cultivable mycorrhizal fungi isolated from C. quadricolor, providing knowledge on the possible mycorrhizal associations of adult C. quadricolor plants, and identifying candidate taxa that may support in vitro seed germination. OMF are essential for natural demographic recruitment, population restoration and orchid conservation initiatives. This study represents an important biological resource for the restoration of the populations of this endemic and critically endangered orchid.
dc.format.extent	114 p.
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.identifier.uri	https://vitela.javerianacali.edu.co/handle/11522/3504
dc.language.iso	spa
dc.publisher	Pontificia Universidad Javeriana Cali
dc.publisher.faculty	Facultad de Ingeniería y Ciencias
dc.rights.accessrights	http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommons	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject	BST
dc.subject	Cattleya quadricolor
dc.subject	Ceratobasidium
dc.subject	Código de Barras de la Vida
dc.subject	conservación ex situ
dc.subject	Endófitos
dc.subject	HMO
dc.subject	Orquídeas
dc.subject	rRNA-ITS
dc.subject	Tulasnella
dc.subject	Barcoding DNA
dc.subject	Conservation ex situ
dc.subject	Endophytes
dc.subject	OMF
dc.subject	Orchids
dc.subject	TDF
dc.thesis.discipline	Facultad de Ingeniería y Ciencias. Biología
dc.thesis.level	Pregrado
dc.title	Caracterización de potenciales hongos micorrízicos aislados de plantas adultas y semillas cebo de la orquídea amenazada, Cattleya quadricolor Lindl (Orchidaceae)	spa
dc.type.coar	http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.local	Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dc.type.redcol	https://purl.org/redcol/resource_type/TP