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A la deriva en un mar cambiante: Explorando las implicaciones del cambio climático en el área de cría de la Ballena jorobada (Megaptera novaeangliae) en el Pacífico Colombiano y Panameño
(Pontificia Universidad Javeriana Cali, 2023) Cuéllar León, José David; Osorio Domínguez, Daniel
El cambio climático global ha llevado a impactar ecosistemas marinos, afectando variables clave para la distribución de la ballena jorobada (Megaptera novaeangliae). Estas alteraciones, derivadas principalmente de actividades antropogénicas, plantean desafíos significativos para la conservación y el estudio de la distribución de esta especie. Para este estudio se tomaron datos de las costas del Pacífico Noroccidental de Colombia y Panamá que coinciden con la Zona Económica Exclusiva y Áreas Protegidas de estos países, siendo cruciales para la reproducción de las ballenas jorobadas. Estas ballenas desempeñan un papel esencial en su ciclo reproductivo, incluyendo procesos fundamentales como el parto y la lactancia, por lo que es crucial comprender los hábitats donde se distribuyen. Fue utilizando el algoritmo de máxima entropía (MaxEnt), implementando variables de temperatura, salinidad, velocidad de corriente, batimetría y distancia de la costa. Se modeló la variación espacial y temporal del hábitat en los diferentes escenarios RCP26 y RCP85 del CMIP5 con los horizontes de tiempo 2050 y 2100 dando un AUC= 0,80 lo que indicó un rendimiento aceptable del modelo. Los resultados mostraron que la salinidad y la batimetría emergen como factores de mayor importancia en la construcción de un modelo de idoneidad de hábitat, en la distribución de Megaptera novaeangliae se experimentó más ganancia en áreas en comparación con las perdidas. El efecto potencial del cambio climático difiere para la especie evaluada en los tamaños de las áreas potenciales de distribución. Los distintos escenarios del modelo revelan cambios importantes en la idoneidad de hábitat especialmente en la costa pacífica de Panamá donde la idoneidad actual es menor a la del modelo. Según las proyecciones del modelo utilizado en el estudio, las áreas protegidas actuales muestran una insuficiencia en términos de tamaño para garantizar la conservación efectiva de la especie. Se recomienda que las acciones de conservación cuenten con una relevancia crucial en anticipar y comprender las respuestas específicas de la especie ante futuras proyecciones de cambio climático, además de aumentar las acciones de monitoreo para obtener predicciones de mayor calidad.
Aislamiento e identificación de bacterias solubilizadoras de fosfatos (BSF) asociadas a la rizósfera de vanilla spp.
(Pontificia Universidad Javeriana Cali, 2019) García Marulanda, Zeneth Vanessa; Mosquera Espinosa, Ana Teresa; Flanagan, Nicola Sian
Los suelos de la región biogeográfica del Choco en la costa pacífica colombiana son altamente ácidos, lo que conduce a una baja disponibilidad de nutrientes para las plantas, en particular el fósforo. Una estrategia adoptada por las plantas a los suelos ácidos es la asociación con microorganismos de la rizósfera, tanto hongos como bacterias, que contribuyen a mejorar la disponibilidad de los nutrientes. La estrategia adoptada por las bacterias rizosféricas solubilizadoras de fosfato contribuyen a mejorar la eficiencia de utilización del mismo. En la presente investigación se evaluó el aislamiento e identificación de bacterias solubilizadoras de fosfato asociadas a la rizósfera de plantas silvestres de Vanilla spp. Para lo cual, se planteó como objetivos: 1) Identificar el mejor medio de cultivo selectivo y la mejor dilución para el aislamiento de Bacterias Solubilizadoras de Fosfato (BSF); 2) Estandarizar la metodología para la preservación y reactivación de BSF; 3) Identificar a nivel molecular, las especies bacterianas presentes en la rizósfera de algunas especies silvestre de Vanilla. De seis especies de Vanilla colectadas en dos municipios del Valle del Cauca fue posible obtener un total de 612 aislamientos, de los cuales 100 fueron seleccionados por morfotipo y de estos 65 fueron identificados hasta especie.. Para considerar el mejor medio de cultivo selectivo y dilución se realizó la prueba de Regresión de Poisson, la cual indicó el medio Pikovskaya (PVK) y la dilución 10-4 como las mejores condiciones para el aislamiento de BSF. La estandarización de la metodología de preservación y reactivación de las BSF mediante el análisis de prueba de Fisher permitió identificar que se pierde el 25% de la población total preservada seis (6) meses después de su preservación. De igual forma, la identificación de los aislamientos se realizó mediante la secuenciación de la región ribosomal 16S y búsquedas BLAST en GenBank predominando géneros como Burkholderia y Bacillus.
Análisis de la expresión de los genes INCENP y PLK1 en las líneas celulares NIH-3T3 y HT-29 y su Asociación con el proceso de inestabilidad genómica
(Pontificia Universidad Javeriana Cali, 2024) Gallego Serna, Daniela; Quimbaya Gómez, Mauricio Alberto
Una característica fundamental del cáncer es la inestabilidad genómica (IG), en la cual el genoma, al acumular mutaciones sin ser detectadas o reparadas, sufre cambios permanentes en la secuencia del ADN. Hay genes desencadenantes de IG entre los cuales se ha reportado PLK1, que es un regulador maestro del proceso de segregación de cromosomas, específicamente en el punto de control G2/M y la citocinesis. La fosforilación mediada por PLK1 facilita la correcta ubicación del huso cromático en el momento y lugar adecuados de la división mitótica. La sobreexpresión de este gen puede llevar a la formación de células binucleadas, inestabilidad cromosómica (IC) y aneuploidía, lo que puede contribuir al desarrollo del cáncer. De igual manera, el gen INCENP participa en el proceso de segregación de cromátidas hermanas y, aunque hay pocos estudios en los que se informe el papel de INCENP como inductor de IG, se cree que podría estar involucrado debido a su participación en el Complejo Pasajero de Cromosomas (CPC). El trabajo de investigación exploró la relación transcripcional entre los genes INCENP y PLK1, evaluando la expresión de ambas moléculas en dos líneas celulares contrastantes, la línea NIH-T3T derivada de fibroblastos de ratón y la línea HT-29 obtenida de adenocarcinoma de colon. Los resultados obtenidos sugieren la posibilidad de una correlación transcripcional entre PLK1 e INCENP, lo que arroja luz sobre la comprensión de los mecanismos asociados con el fenómeno de IG en el proceso de transformación neoplásica.
Armadillo Project - Ambrocio Oy
(Pontificia Universidad Javeriana Cali, 2024) Riascos Cataño, Diana Isabel; Ibañez Quintero, María José; Varela Álvarez, Juan David; Cuenca Perea, Sebastián
Trabajo de grado multidisciplinario En este documento, nos proponemos explorar y desarrollar un implante craneal modular asequible, de alta calidad y biocompatible, dirigido fundamentalmente a países con dificultades para acceder a dispositivos médicos esenciales, con el objetivo de crear un producto seguro y efectivo, además de establecer un modelo sostenible que facilite la producción y distribución a gran escala, enfocado en la equidad y la inclusión en el acceso a la atención. El presente documento se estructurará en tres secciones principales: en primer lugar, se presentará el desafío, detallando la descripción del problema y su justificación; a continuación, se explorará un marco teórico y metodológico que abarcará el contexto de los antecedentes relevantes para el proyecto, seguido de una exposición de la metodología de Design Thinking, trabajando a partir de un esquema que comprende desde la empatía, definición, ideación, prototipado hasta el proceso de validación, ofreciendo una propuesta final junto con un presupuesto asociado; y por último, se realizará una discusión que incluirá conclusiones, oportunidades potenciales para futuras investigaciones, reflexiones sobre el proceso y los aprendizajes adquiridos, así como una sección que describirá el proceso de diseño desde la perspectiva de cada carrera.
Bacterias solubilizadoras de fosfatos aisladas de Vanilla spp. para el biocontrol de Fusarium spp.
(Pontificia Universidad Javeriana Cali, 2024) Cruz Angulo, Andrés Felipe; Mosquera Espinosa, Ana Teresa
La Vainilla es una orquídea hemiepifita que crece en el neotrópico, la cual pertenece a la familia Orchidaceae. Para el 2023, en Colombia se han encontrado más de 4.300 especies de orquídeas, esta variedad en el género ofrece una amplia gama y diversidad en los sabores de las especies de Vainilla. Esta planta posee gran importancia económica a nivel mundial, debido su compuesto principal, el 4-hidrixi-3-metoxibenzaldehido (vainillina). Gracias a este y otros factores de relevancia económica y social, se ha generado la necesidad de buscar diferentes métodos para controlar la diversidad de microorganismos fitopatógenos que perturban los cultivos comerciales de esta especie. Los hongos del género Fusarium afectan una gran variedad de especies de vainilla con extensiones de cultivo comerciales en países como México, Indonesia, Australia, India, China y Puerto Rico, lo que genera pérdidas cercanas al 80% de la producción de esta planta, relacionándose mayoritariamente con las especies Fusarium oxysporum f. sp. vanillae y F. oxysporum f.sp. radicis-vanillae. Son diversas las técnicas de manejo integrado que se utilizan en agricultura para disminuir la acción de los patógenos. Entre los principales métodos de biocontrol se encuentran los mediados por bacterias rizosféricas, entre ellas las Bacterias Solubilizadoras de Fosfatos (BSF). Las BSF representan un 10% de la microbiota del suelo encargada de los ciclos del fosforo (P) en el suelo, debido a la producción de metabolitos secundarios, ácidos y protones que ayudan a la disponibilidad de este elemento, el cual es importante para procesos de nutrición de las plantas; igualmente, las BSF pueden cumplir el papel de inhibidoras del crecimiento microbiano, esto evidenciado en estudios de investigación. El objetivo de esta tesis, estilo monografía, es realizar revisión de literatura científica para evidenciar lo que existe sobre bacterias como antagonistas de Fusarium spp. enfocándose específicamente en BSF que están asociadas a la rizósfera de especies de vainilla presentes en Colombia y el mundo. El tema que se plantea es de interés dentro de la investigación para la producción de vainilla comercial, pues se deben identificar los mecanismos de biocontrol que emplean las BSF y analizar la relación que se presenta con su principal actividad que es solubilizar fosfatos y su capacidad biocontroladora sobre microorganismos fitopatógenos.
Biología reproductiva sexual de la planta invasora ojo de poeta (Thunbergia alata) en una población de bosque andino en el Valle del Cauca
(Pontificia Universidad Javeriana de Cali, 2020) Ramírez Uribe, Laura; Habib Kattan, Gustavo
Thunbergia alata es una planta trepadora nativa de la costa este de África que ha sido introducida en diferentes regiones del mundo especialmente en el neotrópico. Debido su amplia distribución en Colombia, su rápida proliferación y su forma de crecimiento el Instituto de Investigaciones en Biodiversidad Alexander von Humboldt la catalogó como una de las plantas con mayor riesgo de invasión en Colombia. Actualmente se desconoce el sistema de reproducción sexual y hasta qué grado la especialización de los polinizadores nativos y los mecanismos de compatibilidad limita o facilita el potencial invasor de la especie. Este estudio describe la biología reproductiva sexual de T. alata, la actividad de los visitantes florales, su efectividad en la función femenina y la producción y viabilidad de semillas en una población de bosque andino en el Valle del Cauca, Colombia. Se encontró que, en esta población del Valle del Cauca, T. alata presenta un sistema reproductivo con autocompatibilidad parcial (0.84), que depende de la transferencia de polen por parte de los polinizadores para la producción de frutos y semillas. La actividad de los polinizadores es errática y de baja intensidad, pues tan solo se encontraron dos visitantes florales: Eulaema polychrona y Trigona amalthea y la viabilidad de semillas fue del 30%, lo que sugiere que T. alata aún no ha establecido relaciones mutualistas significativas con la entomofauna local y que la reproducción sexual no es la principal presión de invasión dentro del área de estudio, por el contrario, su principal estrategia reproductiva es la reproducción vegetativa. Se sugiere enfocar los planes de manejo y control en reducir el crecimiento vegetativo, sin embargo, debido a que la reproducción sexual puede ser diferente entre poblaciones, se debe incluir en los esfuerzos de monitoreo para que abarquen tanto el componente de reproducción vegetativo como el sexual.
Caracterización del hábitat, presencia, percepción local del manati del Gran Caribe en la laguna Guerrero, Quintana Roo, México
(Pontificia Universidad Javariana Cali, 2024) Espinosa González, Natalia; Castelblanco Martínez, Delma Nataly
El deterioro y la pérdida del hábitat del manatí del Gran Caribe (Trichechus manatus manatus), derivados de las actividades humanas, han provocado una fuerte disminución en sus poblaciones y su distribución según estudios realizados en los últimos 50 años. El Santuario del Manatí, reserva estatal que contiene a la Bahía de Chetumal en el estado de Quintana Roo, cuenta con una gran parte de la población del manatí del Caribe mexicano. Dentro del santuario se ubica el anteriormente llamado Centro de Atención y Rehabilitación de Mamíferos Acuáticos (CARMA) específicamente en Laguna Guerrero. Con el fin de generar información que pueda ser incluida en planes de manejo y conservación de la especie, el objetivo de este estudio fue analizar la presencia del manatí en Laguna Guerrero, evaluar la idoneidad del hábitat como área de liberación de manatíes rehabilitados, y describir la percepción de la comunidad humana en relación con la especie. Se llevaron a cabo 14 recorridos acuáticos entre agosto y diciembre de 2022 para colectar variables fisicoquímicas mensuales en 15 diferentes puntos. Se empleó el sonar de barrido lateral mediante transectos en forma de zigzag a lo largo de la laguna con el fin de caracterizar los fondos del cuerpo de agua y detectar la presencia de individuos de la especie, y, se realzaron avistamientos oportunísticos de manatíes y a partir de observaciones en puntos fijos. No se obtuvieron registros de manatíes durante las navegaciones, pero se registraron 16 avistamientos desde un punto fijo. Se completó un total de 33 avistamientos realizados desde el punto fijo (CARMA) a lo largo del año 2022, indicando que la presencia de manatíes es variable a lo largo del año. Se lograron avistar tanto manatíes en grupos, parejas, madres con cría y solitarios. El mayor número de avistamientos ocurrió en época de lluvias (junio a octubre) (N=22, % =67). Los resultados obtenidos en las observaciones desde el punto fijo difieren con los resultados de las entrevistas, donde se reportó mayor presencia de manatíes en época secas (marzo a mayo). Las entrevistas también evidencian una conciencia en los locales frente al cuidado y protección del manatí, principalmente gracias a la presencia de Daniel, un manatí rehabilitado en el CARMA desde hace 19 años. Así mismo, se encontró que Laguna Guerrero tiene una profundidad de poco menos de siete metros, cuenta con oferta de vegetación sumergida abundante y afloramientos de agua dulce. Sin embargo, a pesar de que Laguna Guerrero reúne las condiciones adecuadas para la supervivencia de un manatí, es fundamental mayor sensibilización en la comunidad para el correcto comportamiento frente a los manatíes, particularmente los que han pasado por procesos de rehabilitación
Caracterización morfológica y bioacústica de una especie de Scytalopus con poblaciones aisladas en el Parque Nacional Natural Farallones de Cali
(Pontificia Universidad Javariana Cali, 2024) Paz Aramburo, Valentina; Estela Uribe, Rodrigo Felipe
En el Parque Nacional Natural Farallones de Cali se identificó una población aislada de Scytalopus, un género de aves conocido por su compleja taxonomía y alta diversidad en los Andes. Este estudio caracterizó bioacústica y morfológicamente un espécimen colectado en esta región, revelando similitudes generales en el plumaje y la estructura corporal con Scytalopus canus, aunque con leves variaciones en la vocalización que sugieren una posible adaptación local o diferenciación geográfica. Se observó también una distribución geográfica distinta en comparación con poblaciones previamente conocidas de S. canus, indicando un posible aislamiento evolutivo. Las muestras de tejido colectadas permitirán futuros estudios genéticos para confirmar si esta población representa una unidad taxonómica distinta, contribuyendo al conocimiento de la biodiversidad andina y los procesos de especiación.
Comparación de la expresión del gen PLK1 en las líneas celulares HEK 293 y HT 29
(Pontificia Universidad Javeriana Cali, 2024) Córdoba López, Laura Vanessa; Quimbaya Gómez, Mauricio Alberto
El cáncer es una enfermedad multifactorial que se caracteriza por la pérdida de la identidad celular en un contexto tisular que inicialmente conduce a una proliferación descontrolada de las células transformadas. Debido al alto grado de complejidad y al gran número de factores que pueden desencadenar la pérdida de identidad celular que conlleva posteriormente a la formación de tumores, en los últimos años se han buscado nuevas aproximaciones para simplificar el estudio de los eventos celulares que pueden iniciar la tumorogénesis. Los modelos matemáticos son una alternativa que facilita el estudio de los mecanismos y redes de interacción molecular involucrados en el inicio o progreso del proceso carcinogénico. Sin embargo, los ensayos experimentales, moleculares y celulares son esenciales para calibrar estos modelos computacionales, verificando las hipótesis generadas in silico y revelando, in vivo, efectos no previstos. En este trabajo, se validó experimentalmente las predicciones del modelo de inestabilidad genómica propuesto por Suescum en el 2020, donde se teoriza que la regulación de la proteína PLK1 sobre los genes AURK, INCENP, KIF2C y PTTG1 podría conducir a inestabilidad genómica a través de 3 circuitos: el complejo pasajero cromosómico, el complejo promotor de la anafase y el complejo del punto de control mitótico. Para validar el modelo, se evaluaron mediante PCR en tiempo real los niveles de expresión de dichos genes en líneas celulares embrionarias de riñón (HEK 293) y tumorales derivadas de adenocarcinoma de colon (HT 29). Los resultados mostraron diferencias en los patrones de expresión que coinciden con las predicciones del modelo matemático y con interacciones reportadas previamente entre PLK1 y los genes evaluados. Sin embargo, la alta variabilidad experimental entre réplicas impide confirmar estas diferencias estadísticamente, por lo que se requieren mejoras metodológicas para aumentar la reproducibilidad y reducir la variabilidad, lo cual fortalecería la posibilidad de asociar las diferencias detectadas con procesos tumorales. Una optimización de los protocolos experimentales y un aumento en el número de réplicas biológicas son esenciales para validar de forma más sólida el modelo matemático propuesto inicialmente.
Composición y diversidad beta de anfibios en el Parque Nacional Natural Farallones de Cali
(Pontificia Universidad Javariana Cali, 2024) Freyre Guaspud, Maria Camila; Osorio Domínguez, Daniel; Valenzuela Ospina, Leonor Adriana
os anfibios son fundamentales en los ecosistemas, sin embargo, son especialmente vulnerables a cambios en su hábitat, y en los últimos años se ha documentado un alarmante declive global en sus poblaciones. En Colombia, el Parque Nacional Natural Farallones de Cali (PNN Farallones) destaca por su alta diversidad de anfibios, pero carece de datos actualizados sobre su distribución y conservación. Este estudio aborda la variabilidad en la composición de las comunidades de anfibios a través del análisis de la diversidad beta, que permite identificar patrones de distribución espacial y temporal de las especies. Los resultados obtenidos en los análisis revelaron que tanto factores temporales como espaciales influyen significativamente en la estructura de las comunidades de anfibios. Se observó una alta diversidad beta (0.93), lo que indica una marcada diferenciación en las comunidades a lo largo del parque, especialmente en el recambio de especies (0.89). Factores ambientales como la altitud y la temperatura mostraron una correlación moderada con la variabilidad en las comunidades, destacándose la influencia del gradiente altitudinal en la composición de especies. Sin embargo, los efectos de las variables empleadas fueron limitados, sugiriendo que factores biológicos y ecológicos también desempeñan un papel importante. Por lo que, se subraya la necesidad de investigaciones adicionales para comprender mejor los factores que afectan la biodiversidad de anfibios en el PNN Farallones, lo que contribuirá a mejorar las estrategias de conservación de esta rica y vulnerable fauna
Construcción de un mapa genético para una variedad comercial de caña de azúcar (Saccharum spp.)
(Pontificia Universidad Javeriana de Cali, 2021) Aguirre Samboní, Giann Karlo; Riascos Arcos, John Jaime
Un mapa genético está compuesto por marcadores moleculares que están separados por distancias genéticas relativas debido a los cruces entre individuos. Los mapas genéticos son usados en el ensamblaje de genomas complejos como los híbridos de la caña de azúcar (Saccharum spp.) porque son genomas altamente heterocigotos, autopoliploides y aneuploides. Para la variedad de caña CC01-1940 se han generado unas secuencias largas llamadas scaffolds y el mapa genético servirá como anclaje de los scaffolds para llegar al nivel de grupos de ligamiento o cromosomas. En este trabajo se muestra la construcción de tres mapas genéticos usando diferentes estrategias a partir de secuenciación de alto rendimiento de una población F1 biparental, resultado del cruce entre las variedades de caña de azúcar CC 01-746 y CC 01-1940. De la progenie fueron secuenciados el genoma completo (WGS) de 93 individuos más ambos padres. Este conjunto de lecturas por individuo fueron alineadas a los scaffolds con resultados superiores al 85 %. Los alineamientos fueron usados parala detección de variantes y selección de marcadores moleculares SNPs de calidad suficiente para construir los mapas. Un total de 3,739 loci, 4,096 loci y 7,816 loci fueron obtenidos respectivamente para cada estrategia de llamado de SNPs. La estrategia A arrojó un tamaño del mapa de 9,679.50 cM con una densidad promedio de 6.05 cM/loci; la estrategia B resultó en un mapa de 1,191.30 cM con una densidad promedio de 1.96 cM/loci; y la estrategia C generó un mapa de 1,198.74 cM con una densidad promedio de 2.19 cM/loci. Esta es la primera vez que CENICANA construye mapas ˜genéticos a partir de datos de secuenciación masiva, lo que significa un pipeline importante para avanzar en el ensamblaje del genoma que esta en construcción y para trabajos futuros de asociación genotipo-fenotipo. Los tres mapas genéticos construidos tienen el potencial de ensamblar grupos de ligamiento a partir de los scaffolds de la variedad. Esta metodología contribuye significativamente a la plataforma de mejoramiento asistida por marcadores moleculares de CENICAÑA.
Crianza asistida enfocada en el bienestar animal de ejemplares de zarigüeya común (Didelphis marsupialis) ingresados en el Hogar de Paso del DAGMA-Cali
(Pontificia Universidad Javariana Cali, 2024) Silva Idrobo, Ana María; Estela Uribe, Rodrigo Felipe ; Albino Sánchez, Leidy Alejandra
Didelphis marsupialis es la especie que ingresa con más frecuencia al Hogar de Paso de Fauna Silvestre del DAGMA debido a múltiples amenazas, como la pérdida de hábitat por urbanización acelerada en áreas periurbanas, atropellamientos vehiculares, ataques de animales domésticos o agresiones por parte de la población. Además, la comunidad suele rescatar crías huérfanas, convirtiendo la crianza asistida en cautiverio como una oportunidad de retornar al medio silvestre. Este estudio compara la crianza asistida estándar con una práctica experimental en el Hogar de Paso, enfocada en el bienestar animal a través de enriquecimiento ambiental y modificación del recinto. Se evaluaron variables como peso, condición corporal y repertorio conductual, utilizando modelos estadísticos mixtos, diagramas de caja y violín y etogramas. Los resultados indican que la practica experimental amplia el repertorio de comportamientos naturales, mejora la condición corporal y garantiza un aumento de peso acorde con los estándares esperados para la especie, contribuyendo potencialmente a una rehabilitación y reintegración más efectiva en el medio silvestre.
Densidad y ocupación de la pava caucana (Penelope Perspicax) en los Farallones de Cali, Valle del Cauca, Colombia: un aporte a la conservación de una especie endémica y amenazada
(Pontificia Universidad Javeriana de Cali, 2021) Valencia Velasco, Juan David; Estela Uribe, Rodrigo Felipe
La Pava Caucana (Penelope perspicax) es una especie de ave endémica del valle geográfico del río Cauca en Colombia, considerada en peligro de extinción (EN). Entre las principales amenazadas para esta especie se considera que la perdida de hábitat, la deforestación, la fragmentación y la cacería han generado un serio problema de reducción y aislamiento de sus poblaciones. A pesar de ser considerada el ave amenazada mejor estudiada en Colombia, aún existen vacíos de información sobre esta especie, principalmente en aspectos ecológicos, poblacionales y demográficos que permitan tomar decisiones y acciones en las diferentes localidades donde las poblaciones remanentes aún existe. Este estudio aporta información ecológica y poblacional relevante del núcleo Farallones de Cali, considerado hasta la fecha como uno de los vacíos de información para esta especie. Por medio de transectos de longitud variada recolecté los datos para realizar las primeras estimaciones de la densidad poblacional y realicé aportes a la historia natural de esta especie con el fin de apoyar la implementación de las acciones de conservación priorizadas en el plan de manejo para la Pava Caucana. Además, realicé un análisis de ocupación para la zona de estudio con el fin de encontrar variables que puedan explicar la probabilidad de ocupación de esta especie en este núcleo poblacional y actualicé el mapa de distribución potencial siguiendo el algoritmo de MaxEnt. La densidad poblacional promedio fue de 9 ind/km2 para una localidad en los Farallones de Cali. Comparé la estimación de la densidad que obtuve con los resultados de otros estudios en diferentes localidades donde existen poblaciones mejor conocidas. Presento datos relevantes sobre la biología reproductiva, dieta y comportamiento de esta especie en este núcleo poblacional. Discuto los diferentes factores que pueden estar explicando la densidad de la Pava Caucana y la probabilidad de ocupación en la zona de estudio. Encontré una relación estrecha entre las coberturas boscosas y la presencia de la especie, sin embargo, confirmamos que la heterogeneidad del paisaje sigue considerándose como un elemento clave para el desarrollo de varios aspectos ecológicos importantes como la alimentación y la reproducción. Sugiero y recomiendo que se realicen mayores esfuerzos de muestreo que aseguren la variabilidad temporal y espacial para aumentar la cantidad de datos de otras localidades del núcleo Farallones de Cali para aumentar el conocimiento y en ese orden de ideas se puedan tomar decisiones de conservación más asertivas en donde se vincule a las comunidades en los procesos de monitoreo.
Desvelando el papel de KIF2C en la progresión y detección temprana del cáncer de mama a través del modelamiento matemático de la red de regulación génica
(Pontificia Universidad Javeriana Cali, 2025) Prado Echeverri, Alejandro; Clavijo Buriticá, Diana Carolina; Quimbaya Gómez, Mauricio Alberto
El cáncer de mama representa una de las principales causas de mortalidad en mujeres a nivel mundial, por lo cual es de importancia estudiar y entender cómo se lleva a cabo la progresión tumoral a nivel celular para proponer algunos mecanismos que permitan un diagnóstico temprano o un tratamiento dirigido. En esta investigación se realizó un enfoque desde la biología de sistemas para modelar matemáticamente la red de regulación génica del gen KIF2C, una kinesina implicada en la dinámica de los microtúbulos y en la estabilidad genómica durante la mitosis y que se presume está involucrado en la progresión del cáncer de mama. Se construyó un modelo utilizando herramientas como CellDesigner bajo los estándares SBML, SBGN, empleando una cinética elemental y bajo la aproximación de la ley de acción de masas. El modelo se construyó y alimentó con base a la información reportada en bases de datos bibliográficos y biológico tales como KEGG, Reactome y Gene Ontology, PUBMED, entre otras. El modelo construido contiene 1714 reacciones y permite simular escenarios de sobreexpresión de KIF2C y su impacto en procesos biológicos como; la apoptosis, el ensamblaje del cinetocoro, la condensación y segregación cromosómica, la proliferación celular y el punto del ensamblaje del huso, el punto de control del daño del DNA, el ciclo celular, la organización del citoesqueleto y citogénesis y la mitosis. Los resultados revelan que la sobreexpresión de KIF2C podría provocar inestabilidad cromosómica, la cual se asocia con el desarrollo y progresión del cáncer de mama, especialmente en su subtipo triple negativo. Esta investigación sugiere que KIF2C podría representar un biomarcador diagnóstico y un blanco terapéutico en este tipo de cáncer.
Diagnóstico demográfico de la especie Dracula chimaera (Rchb.f.) Luer. en el Área Clave de Biodiversidad del Bosque de San Antonio, Km 18, Valle del Cauca
(Pontificia Universidad Javeriana de Cali, 2022) Romero Gómez, Andrés Camilo; Ospina Calderón, Nhora Helena
Las orquídeas integran la familia Orchidaceae y son conocidas por su extraordinaria morfología y ecología muy variadas. El mayor número de especies de orquídeas se encuentra en países neotropicales, como Colombia. Sin embargo, las poblaciones de orquídeas se ven amenazadas por la transformación del hábitat, el cambio climático, el comercio ilegal y amenazas intrínsecas asociadas a la biología de las especies. La demografía permite por una parte establecer cómo se encuentran las poblaciones ante situaciones ambientales. Por otra parte, permite evaluar la respuesta de las poblaciones ante actividades antrópicas y distintas situaciones de manejo. En Colombia, se han estudiado algunas orquídeas utilizando enfoques demográficos que han permitido conocer la dinámica de las poblaciones en especies endémicas y amenazadas, sin embargo, se desconoce el estado de conservación de muchas especies. El género Dracula tiene una distribución silvestre limitada al neotrópico, con la mayor diversidad en los Andes de Colombia. Se reconocen 120 especies en el género. Dracula chimaera es una orquídea endémica de Colombia reportada en los bosques andinos. Esta especie se considera afectada por la destrucción del hábitat y recolección excesiva. Sin embargo, se desconocen muchos aspectos sobre su ecología y las amenazas que han afectado a las poblaciones. Este estudio tuvo como objetivo desarrollar un diagnóstico de una población de Draculachimaera en el Área Clave de Biodiversidad (ACB) del Bosque de San Antonio, Valle del Cauca. Se identificó la población de estudio, se procedió a realizar un marcaje de los individuos y a la toma de datos morfológicos (cantidad de hojas, dimensiones de la hoja bandera, numero de inflorescencias, botones, flores y frutos) para proponer una estructurapor etapas para la especie y hacer la tabla de vida estática. De acuerdo con los resultados de las correlaciones entre las variables, en particular la correlación entre el ancho y longitud de la hoja bandera (r=0.94) y el número de hojas; se propone una estructura de 3 etapas de desarrollo (plántula, juvenil y adulto) para D. chimaera. En total, se censaron 139 plantas, distribuidas en 38 plántulas, 65 juveniles y 36 adultos. Los resultados muestran que la supervivencia aumenta durante las dos primeras etapas de desarrollo, mientras que disminuye en la tercera. La mortalidad disminuye durante el cambio de etapa de plántula a juvenil, mientras que aumenta en la etapa adulta. Con la tabla de vida y su análisis se encontró que la población se encuentra en proceso de decrecimiento con una tasa finita de crecimiento, lambda (λ) menor a uno.Se proponen lineamientos para el monitoreo y la conservación de la subpoblación de D. chimaera en el ACB de Bosque de San Antonio, agrupados en cinco aspectos: 1.Distribución geográfica. 2. Cantidad o calidad del hábitat. 3. Demografía 4. Estudios ecológicos y biológicos. 5. Educación y participación ambiental. Este estudio es un aporte que permite ampliar el conocimiento sobre la ecología y el estado de conservación de la especie D. chimaera .
Diagnóstico general de la avifauna al interior de la Ensenada en el Parque Nacional Natural Utría como un aporte a su conocimiento y conservación
(Pontificia Universidad Javeriana Cali, 2025) Berrio Rojas, Julián David; López Victoria, Mateo
Este estudio caracterizó la avifauna en el Parque Nacional Natural Utría (PNN Utría), ubicado en el departamento del Chocó, Colombia. Mediante transectos, puntos fijos y observaciones oportunistas, realizados entre los meses de octubre y diciembre de 2024, se registraron 115 especies de aves (43 familias, 18 órdenes), contribuyendo en forma significativa a los registros logrados en estudios previos (2022-2023). Los órdenes más diversos fueron Passeriformes, Charadriiformes y Apodiformes, y las familias más destacadas, Thamnophilidae, Thraupidae y Trochilidae. Se registraron especies amenazadas, como Crax rubra (Vulnerable) y Penelope ortoni (En Peligro), junto a aves migratorias como Numenius phaeopus, evidenciando el papel del PNNU como lugar para la conservación y como corredor biológico. En manglares predominan especies como Nyctanassa violacea, mientras que en bosques se registraron Campephilus melanoleucos y Trogon chionurus, y en las playas Charadrius semipalmatus, entre otras aves playeras. La metodología incluyó identificación visual y auditiva, lo que permitió detectar especies de hábitos secretivos. Los resultados destacan la importancia de continuar conservando el PNN Utría, dado su rol en la preservación de aves residentes y migratorias, muchas de ellas catalogadas bajo algún grado de amenaza.
Dieta y evolución del tamaño del encéfalo en murciélagos filostómidos
(Pontificia Universidad Javeriana de Cali, 2021) Ochoa Sanz, Diana Marcela; Rojas Martín, Danny Vale
La dieta es un factor ecológico que explica la diversidad del tamaño del encéfalo en vertebrados.Estudios en murciélagos filostómidos (la familia de mamíferos con mayor diversidad trófica) sugieren que el encéfalo de las especies frugívoras es comparativamente mayor que el de las especies de otros gremios tróficos. Sin embargo, estudios más recientes muestran que al menos el 73% de los filostómidos son omnívoros y presentan gran variación en la proporción y composición de los ítems vegetales y animales que consumen. Agrupar a las especies en gremios discretos y usar un único gremio para los distintos tipos de omnivoría puede no reflejar adecuadamente la complejidad trófica de los filostómidos. Por esta razón, la relación evolutiva entre la dieta y el tamaño del encéfalo en la mayor radiación de murciélagos neotropicales continúa siendo un misterio. En esta tesis se evalúa esta relación evolutiva en 124 especies de filostómidos, utilizando tres aproximaciones a la dieta de las especies que consideran la posición trófica, los óptimos adaptativos de esta variable y distintos tipos de omnivoría. Además, se examina por primera vez la relación entre la dieta y el tamaño relativo de varias estructuras encefálicas. Las especies mayoritariamente y estrictamente herbívoras tienen encéfalos y estructuras encefálicas relacionadas con la memoria espacial y la olfacción proporcionalmente más grandes que las especies animalívoras. En estas últimas, algunas estructuras encefálicas responsables de procesar señales visuales y auditivas son proporcionalmente más grandes que en las primeras. La evolución de distintas estrategias de alimentación pudo impulsar cambios en las dimensiones de varias estructuras encefálicas. Aunque la dieta permite explicar la evolución del tamaño del encéfalo en los murciélagos filostómidos, información detallada sobre la historia natural de las especies puede ayudar a dilucidar las dinámicas de diversificación de este clado.
Diversidad de murciélagos en un bosque restaurado y un relicto de bosque primario en los Andes colombianos
(Pontificia Universidad Javariana Cali, 2024) Morales Romero, Samuel; Rojas Martín, Danny Vale; Osorio Domínguez, Daniel
Este estudio analiza la diversidad taxonómica, filogenética y funcional de ensamblajes de murciélagos filostómidos en dos sitios de la Cordillera Occidental del Valle del Cauca, Colombia: un bosque restaurado (Bachué) y un relicto de bosque primario (Ecotonos). En Bachué se registró mayor riqueza de especies y mayor diversidad funcional, asociadas con una mayor heterogeneidad de hábitats. En Ecotonos, el ensamblaje mostró mayor equitatividad y agrupamiento filogenético, sugiriendo una especialización adaptada a condiciones estables de un bosque primario. La diversidad funcional de Bachué, más amplia, permite múltiples roles ecológicos, mientras que en Ecotonos las especies ocupan nichos más específicos. La disimilitud entre ensamblajes se debe principalmente al anidamiento, ya que Ecotonos es un subconjunto funcional y taxonómico de Bachué. Estos resultados subrayan la importancia de complementar la conservación de bosques primarios con la restauración de áreas degradadas para promover ecosistemas más diversos y funcionales. Este enfoque integrador es clave para mejorar la resiliencia y funcionalidad de los ecosistemas tropicales fragmentados.
Diversidad y conectividad genética del pez damisela Stegastes acapulcoensis en el Pacífico Oriental Tropical: una evaluación para localidades de México, Panamá, Colombia y Galápagos
(Pontificia Universidad Javeriana de Cali, 2021) Marmolejo Guzmán, Valentina; Rodríguez Moreno, Melina
La conectividad genética tiene un papel fundamental en la persistencia de las poblaciones al promover el flujo de genes a partir del intercambio de individuos entre poblaciones. En la mayoría de organismos marinos, la conectividad está influenciada por características de historia de vida de las especies, como la duración de vida larvaria, y también por posibles barreras oceanográficas y geográficas. En este estudio se analizó la conectividad genética del pez damisela Stegastes acapulcoensis entre seis localidades del Pacífico Oriental Tropical (POT) separadas por una distancia geográfica máxima de ≈ 4.070 km. Se examinó la diversidad y estructura genética empleando secuencias de la región control de ADN mitocondrial, detectándose alta diversidad dentro de las localidades (Hd = 0.966) y ausencia de diferenciación genética entre ellas (Φst = 0.013). Estos resultados sugieren que S. acapulcoensis tiene alta conectividad en el POT, lo cual puede ser explicado considerando la duración larvaria pelágica y los patrones de dirección de las corrientes, así como los cambios oceanográficos estacionales y eventos climáticos extremos. La información obtenida es relevante para comprender los patrones de dispersión de especies con historias de vida similares a S. acapulcoensis y para tomar decisiones informadas respecto a evaluación y mejoramiento de las redes de Áreas Marinas Protegidas (AMP's) del POT.
Ecología reproductiva de la orquídea Oncidium Adelaidae, un endemismo colombiano con Heterantia
(Pontificia Universidad Javeriana Cali, 2023) Vallejo Patiño, Santiago Nicolás; Vale González, Ángel; Rojas Martín, Danny Vale
En la polinización por animales, los polinizadores son atraídos por señales visuales y químicas de las plantas y, en la mayoría de los casos, reciben una recompensa floral. En la mayoría de las angiospermas, las flores son uniformes, lo que le permite al animal identificarlas y recordarlas en asociación con los recursos de recompensa. Sin embargo, algunas especies de orquídeas del género Oncidium tienen heterantia: presentan dos tipos de flores en la misma inflorescencia. Se desconocen cuáles son las implicaciones reproductivas de este dimorfismo floral y cuál es su función en los potenciales sistemas miméticos en los que participan estas especies. En este trabajo se compararon los atributos físicos de las flores fértiles (más distales) y estériles (más proximales) de Oncidium adelaidae, un endemismo colombiano con mayor presencia en ecosistemas montanos. Las flores fértiles, con la arquitectura típica del género, son conspicuas según el modelo de visión de las abejas y presentan estructuras especializadas que producen aceites como recompensa floral y facilitan su recolecta por abejas del género Epicharis (confirmado como su polinizador). En cambio, las flores estériles, aunque tienen un aroma similar al de las fértiles, son pequeñas, carecen de segmentos bien diferenciados, no producen recompensas florales sustanciales y son poco atractivas para las abejas. La orquídea no puede autopolinizarse y es autoincompatible. Además, la tasa de visitas a sus flores es muy baja, en especial en poblaciones de bosque nublado. Esta orquídea comparte atributos florales, fenología, distribución espacial, rango altitudinal y polinizador con la liana Stigmaphyllon echitoides. Ambas plantas pudieran conformar sistemas miméticos (batesianos o müllerianos) junto a otras oncidíneas con flores tipo Oncidium. Una comprensión más completa de las implicaciones ecológicas y evolutivas de la heterantia en orquídeas requiere de estudios exhaustivos sobre las recompensas químicas y el papel de cada componente en los sistemas miméticos.

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